Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Nkx6-3Q3UHX8 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Nkx6-3Q3UHX8 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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