Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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Hoxc13P50207 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Hoxc13P50207 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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