Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
RxrgP28705 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxrgP28705 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
RxrgP28705 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxrgP28705 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxrgP28705 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxrgP28705 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
RxrgP28705 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
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