Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Top3bQ9Z321 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms