Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rufy3Q9D394 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rufy3Q9D394 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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