Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Arhgef17Q80U35 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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Arhgef17Q80U35 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Arhgef17Q80U35 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Arhgef17Q80U35 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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