Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbtb40Q6PCS8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbtb40Q6PCS8 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbtb40Q6PCS8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Zbtb40Q6PCS8 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Zbtb40Q6PCS8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms