Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CARMIL2Q6F5E8 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CARMIL2Q6F5E8 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms