Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 9330175E14Rik-201ENSMUST00000180445 4852 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Inhbe-201ENSMUST00000059718 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ptchd4-201ENSMUST00000048691 6890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.03
D130052B06RikQ3UW13 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.59□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Plec-217ENSMUST00000169438 14827 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Scn8a-213ENSMUST00000201549 7120 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms