Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gja5Q01231 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gja5Q01231 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms