Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm3415J3QMS8 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gm3415J3QMS8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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