Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ptk2b-203ENSMUST00000111121 3365 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ablim1-206ENSMUST00000111528 2481 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fgfbp1-202ENSMUST00000199481 2191 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Olfr450-202ENSMUST00000218832 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 2410002F23Rik-202ENSMUST00000071296 4201 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ncl-201ENSMUST00000027438 8202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Prpf4-201ENSMUST00000084524 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Adgrl4-201ENSMUST00000046977 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43792-201ENSMUST00000202492 2210 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cpsf2-201ENSMUST00000047357 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm12826-201ENSMUST00000121841 379 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm26710-201ENSMUST00000181265 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ddx19b-201ENSMUST00000040241 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Slc39a9-201ENSMUST00000085245 5201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Nufip1-201ENSMUST00000022586 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Cyhr1-202ENSMUST00000081291 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 St3gal1-201ENSMUST00000092640 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Numb-201ENSMUST00000021647 1815 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mmgt1-201ENSMUST00000059899 4234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Spag8-201ENSMUST00000084646 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Trps1-206ENSMUST00000184458 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Plch1-202ENSMUST00000059973 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Itga7-201ENSMUST00000099112 4013 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Zfp62-203ENSMUST00000109198 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Myo5c-201ENSMUST00000036555 6727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ank3-210ENSMUST00000182155 6375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 4933416O17Rik-201ENSMUST00000220972 2122 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Dcaf11-206ENSMUST00000128490 2660 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Kif14-203ENSMUST00000189413 8943 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm10822-201ENSMUST00000181596 2320 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Numb-207ENSMUST00000129335 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Trpm3-205ENSMUST00000099566 1619 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm24362-201ENSMUST00000183220 416 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Gm20538F6Z9R1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms