Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A3

Ntn3, Netrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntn3Q9R1A3 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ntn3Q9R1A3 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Ntn3Q9R1A3 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Ntn3Q9R1A3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms