Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A5

Nek3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek3Q9R0A5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nek3Q9R0A5 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms