Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

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Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tnfrsf10bQ9QZM4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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