Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Borcs6Q9D6W8 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Borcs6Q9D6W8 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms