Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TIMM29Q9BSF4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms