Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

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Length 1,248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Smc1bQ920F6 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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