Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ssbp4Q3U4B1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms