Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRIM28Q13263 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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