Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
GscQ02591 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
GscQ02591 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms