Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
COPAP53621 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
COPAP53621 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms