Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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GPC1P35052 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
GPC1P35052 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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