Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
NdnP25233 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
NdnP25233 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
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