Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm340F6RGI3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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