Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Brd1E9PZ26 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 982.1 ms