Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Zbed3Q9D0L1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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Zbed3Q9D0L1 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Zbed3Q9D0L1 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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