Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atl3Q91YH5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms