Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BcanQ61361 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms