Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms