Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Trappc9Q3U0M1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms