Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP2P78314 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms