Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF135P52742 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF135P52742 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms