Protein–RNA interactions for Protein: F6VKC7

Zfp988, Zinc finger protein 988, mousemouse

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp988F6VKC7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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Zfp988F6VKC7 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Zfp988F6VKC7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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