Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Brd1E9PZ26 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms