Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Uhrf1bp1B2KF50 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms