Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Mis12Q9CY25 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms