Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm35713-201ENSMUST00000210516 199 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rrbp1Q99PL5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms