Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Zfp961-203ENSMUST00000132848 781 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm13008-201ENSMUST00000142289 507 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Kdm5dQ62240 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm1110-201ENSMUST00000115261 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Kdm5dQ62240 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
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