Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Prrx2Q06348 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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