Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

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Length 857 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Kcnb1Q03717 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Kcnb1Q03717 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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