Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

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Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Csn1s1P19228 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Csn1s1P19228 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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