Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GTF2IRD1Q9UHL9 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms