Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZS5

Rnf183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf183Q8QZS5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm43084-201ENSMUST00000200696 947 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Rnf183Q8QZS5 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms