Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Sgo2Q7TSY8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Sgo2Q7TSY8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms