Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
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Fam208bQ5DTT3 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Fam208bQ5DTT3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
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Fam208bQ5DTT3 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Fam208bQ5DTT3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
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