Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TGM3Q08188 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TGM3Q08188 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TGM3Q08188 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms