Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Siah1bQ06985 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms