Protein–RNA interactions for Protein: P97329

Kif20a, Kinesin-like protein KIF20A, mousemouse

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Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif20aP97329 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Kif20aP97329 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Kif20aP97329 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms