Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Hoxd8P23463 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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